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[Nota técnica N. 01/20] Indización de documentos sobre el COVID-19 y Coronavirus del Síndrome Respiratoria Aguda Grave 2 (SRAG-CoV-2)

7 de febrero de 2020

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Texto completo

Objetivo: : Orientar la indización de documentos sobre Coronavirus del Síndrome Respiratoria
Aguda Grave 2 (SRAG-CoV-2) y la Infección por el Nuevo Coronavirus 2019 (COVID-19) en las
bases de datos LILACS y de la BVS
Público objetivo: profesionales de información
Contenido: metodológico
Metodología: LILACS
Sistema de gestión: FI-Admin, LILDBI-Web u otro que adopte la metodología LILACS u el servicio de DeCS
Fecha de creación: 07/02/2020
Fecha de actualización: 15/04/2020

Introducción

Estas reglas de indización de la metodología LILACS son basadas en las recomendaciones publicadas y enviadas por la National Library of Medicine. En este momento no hay descriptores autorizados para esta documentación, pero hay los conceptos incluidos en el Supplementary Concept Record (SCR) de 2020 que es un vocabulario donde NLM incluye y monitorea términos que pueden o no tornarse descriptores en el Medical Subject Headings (MeSH). Si hay cambio, esta nota técnica será actualizada por BIREME/OPS/OMS. Esta es la tercera versión de la NT01/2020

Definición

La COVID-19 es una enfermedad viral caracterizada por fiebre alta; tos, disnea; disfunción renal y otros síntomas de una neumonía viral. El coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave2 (SRAG-CoV-2) en el género betacoronavirus es el agente sospechoso. (MeSH/NLM).

Los primeros casos de neumonía se comunicaron a la OMS en Wuhan, una ciudad situada en la provincia china de Hubei, el 31 de diciembre de 2019. (OMS, 2020)

Regla general y tipo de descriptores

Atribuir descriptores que son discutidos en la publicación como de la enfermedad “Infecciones por Coronavirus” y el virus “Betacoronarvirus” y evitar aplicar descriptores muy generales como “Salud Pública”, “Epidemiologia” o “Vigilancia Sanitaria”, que generalmente son aplicados como especialidades o áreas de conocimiento.

Descriptores de virus y enfermedades en general son utilizados como primarios si son el foco o tema principal de la publicación. En las notas de indización hay instrucciones de como utilizar los descriptores.

Siempre adoptar las coordinaciones (uso en conjunto) de los descriptores recomendados en las notas de indización y en esta nota técnica.

Terminología más utilizada en las publicaciones

Ver anexo al final de esta nota técnica.

Resumen de las reglas

Publicaciones con los temas destacados en las instrucciones de NLM deben adoptar las recomendaciones de indización en la Metodología LILACS:

Instrucciones de NLM con uso de conceptos SCR

Indización en la Metodología LILACS

COVID-19 – incluir SARS CoV-2 Infecciones por Coronavirus
Neumonía Viral
Pandemias
Betacoronavirus
COVID-19 serotherapy: incluir COVID-19 /ther +
SARS-CoV-2
Infecciones por Coronavirus/terapia
Neumonía Viral/terapia
Pandemias
Inmunización Pasiva
Betacoronavirus
spike glycoprotein, COVID-19 virus: incluir SARSCoV-2 Betacoronavirus
Glicoproteína de la Espiga del Coronavirus
COVID-19 drug treatment: incluir COVID-19 /drug
ther + SARS-CoV-2
ther + SARS-CoV-2
Infecciones por Coronavirus/tratamiento farmacológico
Neumonía Viral/ tratamiento farmacológico
Pandemias
Betacoronavirus
• Incluir el calificador /efecto de drogas si es discutido
en el documento
COVID-19 pruteste diagnostic testing: incluir COVID19/diag + SARS-CoV-2 + técnica diagnóstica
específica, si discutido
Infecciones por Coronavirus/diagnóstico
Neumonía Viral/diagnóstico
Pandemias
Betacoronavirus
Incluir la técnica específica, si discutido
COVID-19 vaccine: incluir SARS-CoV-2 /immunol +
COVID-19 /prev
Vacunas Virales
Betacoronavirus/inmunología
Infecciones por Coronavirus/prevención y control
Neumonía Viral/prevención y control
Pandemias/prevención y control
severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
(SARS-CoV-2 ): sin instrucción específica adicional
Betacoronavirus
LAMP assay: cuando usado para detección de la
COVID-19, adoptar COVID-19 /diag + SARS-CoV-2
+ COVID-19 diagnostic testing
Infecciones por Coronavirus/diagnóstico
Neumonía Viral/diagnóstico
Pandemias
Betacoronavirus/inmunología
Técnicas de Amplificación de Ácido Nucleico
Técnicas de Diagnóstico Molecular

Nuevos conceptos incluidos en el SCR

Los conceptos incluidos en el SCR en abril de 2020:

COVID-19 serotherapy COVID-19 diagnostic testing

COVID-19 diagnostic testing

COVID-19 convalescent plasma treatment
COVID-19 convalescent serum treatment
COVID-19 hyperimmune globulin therapy
COVID-19 serum therapy
COVID19 hyperimmune globulin therapy
COVID19 serotherapy
COVID19 serum therapy
Covid-19 convalescent sera treatment
SARS-CoV-2 convalescent plasma treatment
SARS-CoV-2 convalescent sera treatment
SARS-CoV-2 convalescent serum treatment
convalescent plasma treatment for Covid-19
convalescent serum treatment for Covid-19
coronavirus disease 2019 serotherapy
coronavirus disease-19 serotherapy
hyperimmune globulin therapy for COVID-19
2019 novel coronavirus disease testing
2019 novel coronavirus testing
2019-nCoV disease testing
2019-nCoV infection testing
2019-nCoV testing
COVID-19 testing
COVID-19 virus testing
COVID19 testing
COVID19 virus testing
SARS-CoV-2 testing
SARS2 testing
coronavirus disease 2019 testing
coronavirus disease-19 testing
severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 testing

COVID-19 drug treatment

COVID-19 vaccine

Covid-19 treatment
coronavirus disease 2019 drug treatment
coronavirus disease-19 drug treatment
treatment of Covid-19 virus infection
2019 novel coronavirus vaccine
2019-nCoV vaccine
2019-nCoV vaccine Ad5-nCoV
2019-nCoV vaccine ChAdOx1
2019-nCoV vaccine mRNA-1273
Ad5-nCoV 2019-nCoV vaccine
Ad5-nCoV COVID-19 vaccine
Ad5-nCoV vaccine
BNT162 vaccine
COVID-19 artificial antigen presenting cells vaccine
COVID-19 vaccine Ad5-nCoV
COVID-19 vaccine mRNA-1273
COVID-19 virus vaccine
COVID19 vaccine
COVID19 virus vaccine
ChAdOx1 2019-nCoV vaccine
ChAdOx1 COVID-19 vaccine
Covid-19 aAPC vaccine
INO-4800 vaccine
LV-SMENP-DC COVID-19 vaccine
MNA SARS-CoV-2 S1 subunit vaccines
PittCoVacc
SARS-CoV-2 vaccine
SARS2 vaccine
Wuhan coronavirus vaccine
coronavirus disease 2019 vaccine
coronavirus disease 2019 virus vaccine
coronavirus disease-19 vaccine
lentiviral minigene vaccine of COVID-19 coronavirus
mRNA 1273 vaccine
mRNA-1273 2019-nCoV vaccine
mRNA-1273 COVID-19 vaccine
mRNA-1273 vaccine
microneedle arrays SARS-CoV-2 S1 subunit vaccines
novel coronavirus vaccine
recombinant novel coronavirus vaccine adenoviral vector5
LAMP assay spike glycoprotein, COVID-19 virus
LAMP loop-mediated isothermal amplification
LAMP technique
RT-LAMP
RT-LAMP assay
isothermal amplification loop mediated reverse transcription
isothermal amplification loop-mediated
loop mediated isothermal amplification
loop-mediated isothermal amplification
loop-mediated isothermal amplification LAMP
loop-mediated isothermal amplification technique
reverse transcription LAMP
reverse transcription loop mediated isothermal amplification
reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification
2019-nCoV spike glycoprotein
2019-nCoV spike protein
COVID-19 virus S protein
COVID-19 virus spike glycoprotein
COVID-19 virus spike protein
SARS-CoV-2 S protein
SARS-CoV-2 spike protein
coronavirus disease 2019 virus spike glycoprotein
coronavirus disease 2019 virus spike protein
coronavirus disease-19 virus spike glycoprotein
severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 spike
glycoprotein
severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 spike protein

Reglas de Indización de documentos según Metodología LILACS

Para describir el virus que causa la COVID-19 el término severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 fue creado por National Library of Medicine (NLM) en el MeSH Supplementary Concept Record

severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

Ilustración 1 – Severe acute respiratory syndrome coronavirus en el MeSH Supplementary Concept Record

Adoptar el descriptor Betacoronavirus en las publicaciones que tratan del Coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2 en la descripción de la fisiología, clasificación, química, metabolismo, aislamiento, crecimiento y desarrollo, ultraestructura, inmunología, enzimología, genética, efectos de radiación, efectos de fármacos y patogenicidad del virus (calificadores disponibles). (Ver Nota Técnica de National Library of Medicine)

Ilustración 2- Descriptor Betacoronavirus en el DeCS

Ilustración 2- Descriptor Betacoronavirus en el DeCS

Para la indización de la enfermedad por el coronavirus (COVID-19) se debe adoptar la coordinación/combinación de los descriptores: Neumonía Viral, Infección por Coronavirus y Pandemias (NUEVO).

Ilustración 3 – COVID-19 en el MeSH Supplementary Concept Record

Si la publicación trata de la transmisión, diagnóstico, terapia, prevención y control y cualquier de los aspectos/calificadores disponibles en el descriptor, adoptar el mismo calificador para los tres descriptores, si hay.

A seguir los tres descriptores como presentado en el servicio del DeCS en FI-Admin:

Ilustración 4 - Descriptor Infecciones por Coronavirus en el DeCS

Ilustración 4 – Descriptor Infecciones por Coronavirus en el DeCS

Ilustración 5 - Descriptor Neumonía Viral en el DeCS

Ilustración 5 – Descriptor Neumonía Viral en el DeCS

Adoptar el descriptor Pandemias como coordinación con los descriptores anteriores para describir la enfermedad:

Ilustración 6 - Descriptor Pandemias en el DeCS

Ilustración 6 – Descriptor Pandemias en el DeCS

Recién National Library of Medicine ha lanzado varios otros conceptos en el Supplementary. Para publicaciones sobre transferencia de inmunidad desde hospederos inmunizados a no inmunes por la administración de anticuerpos séricos, o por el trasplante de linfocitos indizar con Inmunización Pasiva e Infecciones por Coronavirus/terapia.

Ilustración 7 - COVID-19 serotherapy en el MeSH Supplementary Concept Record

Ilustración 7 – COVID-19 serotherapy en el MeSH Supplementary Concept Record

Ejemplo: A novel treatment approach to the novel coronavirus: an argument for the use of
therapeutic plasma exchange for fulminant COVID-19i.

Descriptores Primarios

Coronavirus Infections/therapy
Pneumonia, Viral/therapy
Plasma Exchange/methods

Descriptores Secundarios

Betacoronavirus
Biomarkers/blood
Coronavirus Infections/diagnosis
Immunization, Passive
Pandemics/prevention & control
Pneumonia, Viral/diagnosis
Respiration, Artificial
Severe Acute Respiratory Syndrome

Precodificado

Humans

Tipo de publicación

Editorial

El concepto spike glycoprotein, COVID-19 virus debe ser indizado con el descriptor Glicoproteína de la Espiga del Coronavirus.

Precodificado – Embarazo

Todos los documentos sobre mujeres embarazadas o animales preñados deberán tener ese aspecto indizado. Siempre incluir Femenino y Humanos u Animales).

Ejemplo 1: Efecto de la penicilina en el hígado (el texto se refiere a hombres y mujeres, una de las cuales está embarazada).

Descriptores primarios
Penicilinas /farmacol
Hígado /ef drogas

Precodificados
Humanos
Masculino
Femenino
Embarazo

Ejemplo 2: Efecto de la penicilina en el hígado de perros (el estudio utiliza perros machos y hembras como animales de experimentación y una de las hembras está preñada).

Descriptores primarios
Penicilina /farmacol
Hígado /ef drogas

Precodificados
Perros
Animales
Femenino
Embarazo y no Preñez

Precodificados – Edades

Seleccionar todos los grupos de edades descritos en el documento, incluso si parece obvio.

Ejemplo:
Conducta infantil, deberá ser indizado con: Humanos, Niño o específico conforme el documento.

  • Rango de edad

Cuando el documento presenta un rango de edades seleccionar todos los grupos pertinente.

Ejemplos:
Sujetos con edades de 7 hasta 79, deberá ser indizado con: Humanos, Niño, Adolescente, Adulto Joven, Adulto, Mediana Edad y Anciano.
Sujetos con edades de 19 a 44, indizar con: Humanos, Adulto Joven y Adulto.

  • Rango de edad expresa con signos con signos + (suma) y – (resta)

Edades que aparecen entre paréntesis con signos + -, hacer las cuentas para menos y para más e incluir todas las edades.

Ejemplo:
Pacientes con edades (56+-10 años), la indización será: Humanos, Mediana Edad y Anciano.

Reglas para grupos de edad:

Si en el documento consta

Use

No use

Lactante Lactante(1 hasta 23 meses Recién Nascido (hasta 1 més) y Lactante (1 a 23 meses)
Niño Niño (6-12) Preescolar (2-5) y Niño (6-12)
Adulto Adulto (19-44) Mediana Edad (45-64), Adulto (19-44) y Adulto Joven (19-24)

Precodificados – Animales

Los estudios experimentales con uso de modelos animales o estudios sobre enfermedades animales deben incluir el precodificado Animales y cuando especificado indizar también: Masculino, Femenino, Ratas, Ratones, Cobayas etc.

Además de los precodificados, si el documento cita, incluir como descriptor secundario la especie del animal.

Ejemplo: Ratas Wistar, Ratas Sprague-Dawley

Precodificados x Descriptores

Algunos precodificados pueden ser indizados como descriptor primario, cuando son el tema central/principal del documento.

Precodificados no aceptan calificadores. Por consiguiente, cuando sea necesario usar un calificador, el deberá ser indizado como descriptor primario con uno de los calificadores disponibles.

Los precodificados: Humanos, Animales, Masculino y Femenino, nunca son indizados como primario.

  • Embarazo normal

Embarazo será indizado como descriptor primario solamente para estudios de embarazo normal como foco principal del documento.

Ejemplo: Fisiología del embarazo en países en desarrollo.

Descriptores primarios
Embarazo/fisiol
Países en Desarrollo

Precodificados
Humanos
Femenino

  • Recién nacido normal

Si el recién nacido normal es el asunto principal del documento se debe usar el descriptor Recién Nacido como descriptor primario.

Ejemplo: Aspectos fisiológicos de la respiración en el recién nacido.
Descriptores primarios
Respiración/fisiol
Recién nacido/fisiol

Precodificados
Humanos

*Nota: Cuando se indiza Recién nacido o Embarazo como descriptor primario, NO indizar también como precodificados, pues habrá duplicación de descriptores.

Documentos sobre enfermedades en recién nacido son indizados por el descriptor de la enfermedad específica (primario o secundario) y con el precodificado Recién Nacido (más Humanos y Masculino o Femenino si declarado).

Precodificados: coordinaciones

Algunos términos DeCS/MeSH exigen la indización de los precodificados pertinentes.

Ejemplos:
Adolescente hospitalizado: coordinar con Humanos y Adolescente
Mastitis bovina: coordinar con Animal y Bovino
Neoplasias da Próstata: coordinar con Humanos y Masculino

Agradecimientos

Al equipo de la Biblioteca Médica Nacional del Centro Nacional de Información de Ciencias Médicas – INFOMED por la revisión de las notas técnicas.

Referencias

BIREME/OPAS/OMS. Manual de Indización de Documentos para la Base de Datos LILACS. 2.ed. rev. ampl. São Paulo: BIREME, 2008. 373 p. Disponible en:
http://docs.bvsalud.org/biblioref/2018/05/883287/lilacs-4-manualindexacao-es.pdf. Acceso en 07/05/2018.
Conceição, Maria Anália da; Suga, Sueli Mitiko Yano. Sesión 3 de 10 – Uso de precodificados en la indización de documentos LILACS [Presentación]. 25 Mayo. 2017. Disponible en: https://www.slideshare.net/Rede_BVS/sesin-2-de-10-indización-con-uso-de-precodificadoslímites. Acceso en 07/05/2018.

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