Para indexação na LILACS, são aceitos periódicos publicados em português, espanhol, inglês ou francês, que são os idiomas oficiais nos países da região. 

É desejável que os artigos sejam publicados no idioma predominante no país ou do público-alvo do periódico e recomenda-se que o título, o resumo e as palavras-chave estejam também disponíveis em inglês, para facilitar o acesso à informação científica e técnica tanto à comunidade local quanto aos pesquisadores estrangeiros.

Artigos de línguas indígenas como aimara, guarani e quíchua são passíveis de inclusão, porém recomenda-se versão em um dos idiomas oficiais do país para ampla difusão.