A cobertura temática da LILACS é flexível, contemplando artigos de relevância e impacto na saúde humana. 

Os periódicos devem ser direcionados a acadêmicos, pesquisadores, profissionais de saúde, autoridades e gestores de saúde pública, cobrindo as seguintes áreas temáticas: Biomedicina, Ciência da Informação, Ciências Agrárias, Ciências Biológicas, Comunicação Social, Educação, Educação Física, Enfermagem, Farmácia, Fisioterapia, Fonoaudiologia, Medicina (Clínica Médica e Cirurgia), Medicina Veterinária e Zootecnia, Nutrição, Odontologia, Psicologia, Saúde Pública, Terapia Ocupacional e áreas interdisciplinares.

Periódicos que apresentem pelo menos 50% de artigos relacionados à saúde em cada volume serão indexados seletivamente, considerando apenas os conteúdos pertinentes, e não o periódico em sua totalidade.

Recomenda-se a publicação de estudos sobre determinantes sociais da saúde específicos da América Latina e Caribe (AL&C), saúde indígena, saúde de populações vulneráveis e doenças negligenciadas e estudos que contribuam para o cumprimento do Objetivo de Desenvolvimento Sustentável 3 (ODS 3), abrangendo temas críticos como a redução da mortalidade materna e infantil, a erradicação de doenças transmissíveis (AIDS, tuberculose, malária, entre outras) e o combate às doenças não transmissíveis. Este objetivo inclui também a promoção da saúde mental, a prevenção de acidentes, o acesso universal aos serviços de saúde sexual e reprodutiva e a garantia de cobertura universal de saúde. Além disso, é essencial promover a pesquisa e o desenvolvimento de vacinas e medicamentos, bem como fortalecer as capacidades de resposta a emergências de saúde. Estudos sobre os impactos das mudanças climáticas na saúde — especialmente em relação à vulnerabilidade a doenças, desastres naturais e alterações nos padrões de transmissão — também são altamente considerados.