La Metodología LILACS es utilizada para la creación y gestión de bases de datos nacionales, temáticas e institucionales.
En 2020 ocurrieron las migraciones de las bases de datos BDENF(Base de datos en Enfermería), LIPECS (Literatura Peruana en Ciencias de la Salud), SES-SP (Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo) para FI-Admin
El acceso a las bases de datos es realizado en la interfaz de búsqueda de sus BVS:
BDENF: /https://pesquisa.bvsalud.org/enfermeria/?output=site&lang=es
SES/SP: https://pesquisa.bvsalud.org/ses/?output=site&lang=es
LIPECS: https://pesquisa.bvsalud.org/peru/ (en construción)