03/24 – COVID-19 y SARS-CoV2

Nota técnica 03/2024

Indización de documentos sobre el COVID-19 y Coronavirus del Síndrome Respiratoria Aguda Grave 2 (SARS-CoV2)

Objetivo: Orientar la indización de documentos sobre Coronavirus del Síndrome Respiratoria Aguda Grave 2 (SARS-CoV2) y la Infección por el Nuevo Coronavirus 2019 (COVID-19) en las bases de datos LILACS y de la BVS.
Público objetivo: profesionales de información Contenido: metodológico
Metodologia: LILACS Sistema: FI-Admin, LILDBI-Web u otro que adopte la metodología LILACS u el servicio de DeCS
Fecha de creación:07/02/2020 Fecha de actualización: 24/02/2024

 

Introducción

Estas reglas de indización de la metodología LILACS son basadas en las recomendaciones publicadas y enviadas por la National Library of Medicine.

Con la inclusión de los descriptores exactos en las versiones del MeSH 2021 y otros, las instrucciones para la indización han cambiado conforme lo que sigue.

Definición

La COVID-19 es un trastorno viral generalmente caracterizado por FIEBRE alta; TOS, DISNEA, ESCALOFRÍOS, TEMBLOR PERSISTENTE, DOLOR MUSCULAR, CEFALEA, DOLOR DE GARGANTA, pérdida del gusto y / o del olfato (ver AGEUSIA y ANOSMIA) que son de nueva aparición, así como por otros síntomas de una NEUMONÍA VIRAL. En casos graves, se observa una miríada de síntomas asociados a la coagulopatía que a menudo se correlacionan con la gravedad del COVID-19. (p. Ej., COAGULACIÓN SANGUÍNEA, TROMBOSIS, SÍNDROME DE DIFICULTAD RESPIRATORIA AGUDA, CONVULSIONES, ATAQUE CARDÍACO, ACCIDENTE CEREBROVASCULAR, Múltiples INFARTOS CEREBRALES, INSUFICIENCIA RENAL, SÍNDROME DEL ANTICUERPO ANTIFOSFOLÍPIDO catastrófico y/o COAGULACIÓN INTRAVASCULAR DISEMINADA). En pacientes más jóvenes raros síndromes inflamatorios a veces se asocian con COVID-19 (p. Ej., SÍNDROME DE KAWASAKI atípico, SÍNDROME DE CHOQUE TÓXICO, enfermedad inflamatoria multisistémica pediátrica y SÍNDROME DE TORMENTA DE CITOCINAS). Un coronavirus SARS-CoV-2 del género BETACORONAVIRUS es el agente causante.

Los primeros casos de neumonía se comunicaron a la OMS en Wuhan, una ciudad situada en la provincia china de Hubei, el 31 de diciembre de 2019. (OMS, 2020)

Regla general y tipo de descriptores

Atribuir el descriptor COVID-19 al revés de “Infecciones por Coronavirus” y el virus “Betacoronarvirus” como instruido anteriormente porque en 2021 fue creado el descriptor exacto, no siendo más necesaria la aplicación de dicha coordinación de descriptores.

Descriptores de virus y enfermedades en general son utilizados como primarios si son el foco o tema principal de la publicación. En las notas de indización hay instrucciones de como utilizar los descriptores.

Siempre adoptar las coordinaciones (uso en conjunto) de los descriptores recomendados en las notas de indización y en esta nota técnica.

Terminología más utilizada en las publicaciones

Ver anexo al final de esta nota técnica.

Resumen de las reglas

Publicaciones con los temas destacados en las instrucciones de NLM deben adoptar las recomendaciones de indización en la Metodología LILACS:

Instrucciones de NLM con uso de conceptos SCR

Indización en la Metodología LILACS

COVID-19 – incluir SARS CoV-2, si discutido COVID-19
COVID-19 serotherapy: incluir COVID-19 /ther +
SARS-CoV-2, si discutido
Sueroterapia para COVID-19
spike glycoprotein, COVID-19 virus: incluir SARSCoV-2, si discutido Glicoproteína de la Espiga del Coronavirus
COVID-19 drug treatment: incluir SARS-CoV-2, si discutido  COVID-19/tratamiento farmacológico

Incluir el calificador /efecto de drogas si es discutido en el documento

COVID-19 Nucleic Acid Testing

COVID-19 Serological Testing

COVID-19 Testing

 

COVID-19/diagnóstico

Incluir la técnica específica, si discutido:

Prueba de Ácido Nucleico para COVID-19

Prueba Serológica para COVID-19

Prueba de COVID-19

COVID-19 vaccine: incluir SARS-CoV-2 /immunol + COVID-19 /prev Vacunas contra la COVID-19
SARS-CoV-2/inmunología
COVID-19/prevención y controlSi el documento trata especificamente es sobre la vacuna:AZD1222
ChAdOx1 COVID-19 Vaccine
Covishield
Vacuna COVID Oxford – AstraZeneca
Vacuna COVID-19 AstraZeneca
Vacuna COVID-19 Oxford – AstraZeneca
Vaxzevria=>Indizar la vacuna específica ChAdOx1 nCoV-19O sobre la vacuna:Abdavomeran
BNT-162A1
BNT-162B1
BNT-162B2
BNT-162C2
BNT162A1
BNT162B1
BNT162B2
BNT162C2
COVID 19 Vaccine Pfizer BioNTech
COVID-19 Vaccine Pfizer-BioNTech
Comirnaty
Pfizer Covid-19 Vaccine
Pfizer-BioNTech, COVID-19 Vaccine
Pidacmeran
Tozinameran
Vaccine Pfizer-BioNTech, COVID-19
Vaccine, BNT162=>Indizar la vacuna específica BNT162 VaccineO sobre:2019 nCoV Vaccine mRNA 1273
CX 024414
CX-024414
CX024414
Elasomeran
M 1273
M-1273
M1273
Moderna COVID-19 Vaccine
Moderna COVID-19 Vaccine RNA
Spikevax
TAK-919
mRNA 1273
mRNA 1273.211
mRNA-1273
mRNA-1273, 2019-nCoV Vaccine
mRNA-1273.211=>Indizar la vacuna específica Vacuna nCoV-2019 mRNA-1273O sobre la vacuna:Ad26.COV2.S
JNJ 78436735
JNJ-78436735
Johnson & Johnson Covid-19 Vaccine=>Indizar la vacuna específica Ad26COVS1
severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
(SARS-CoV-2 ): sin instrucción específica adicional
SARS-CoV-2
LAMP assay: cuando usado para detección de la
COVID-19, adoptar COVID-19 /diag + SARS-CoV-2
+ COVID-19 diagnostic testing
COVID-19/diag
SARS-CoV-2
Técnicas de Amplificación de Ácido Nucleico
Técnicas de Diagnóstico Molecular

Nuevos conceptos incluidos en el SCR

Los conceptos incluidos son actualizados anualmente.

Por favor revisar notas técnicas técnicas de National Library of Medicine, especialmente: COVID-19 and SARS-CoV-2 MeSH Terms—2021 y More New MeSH Supplementary Concept Records for COVID-19 (2020), cuando muchos conceptos del SCR fueron agregados como descriptores autorizados fueron creados.

Reglas de Indización de documentos según Metodología LILACS

Para describir el virus que causa la COVID-19 el término severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 fue creado por National Library of Medicine (NLM) pero reemplazado por el propio termino COVID-19 en el año siguiente:

covid-19-mesh
Ilustración 1 – descriptor COVID-19

Adoptar el descriptor COVID-19 en las publicaciones que tratan delCOVID-19, en la descripción de la fisiología, clasificación, química, metabolismo, aislamiento, crecimiento y desarrollo, ultraestructura, inmunología, enzimología, genética, efectos de radiación, efectos de fármacos y patogenicidad del virus (calificadores disponibles).

 

Si la publicación trata de la transmisión, diagnóstico, terapia, prevención y control y cualquier de los aspectos/calificadores disponibles en el descriptor, adoptar el mismo calificador para los tres descriptores, si hay.

Coordinar COVID-19 con Pandemias si discutido.


Ilustración 6 – Descriptor Pandemias en el DeCS

El descriptor COVID-19 serotherapy debe ser asignado para publicaciones sobre transferencia de inmunidad desde hospederos inmunizados a no inmunes por la administración de anticuerpos séricos, o por el trasplante de linfocitos indizar con Inmunización Pasiva e Infecciones por Coronavirus/terapia.


Ilustración 7 – descriptor COVID-19 serotherapy en el DeCS/MeSH

 

Ejemplo:
A novel treatment approach to the novel coronavirus: an argument for the use of therapeutic plasma exchange for fulminant COVID-19i.

Descriptores Primarios

Sueroterapia para COVID-19
Plasma Exchange/methods

Descriptores Secundarios

Biomarkers/blood
COVID-19/diagnosis
Immunization, Passive
Respiration, Artificial

Precodificado

Humans

Tipo de publicación

Editorial

El concepto spike glycoprotein, COVID-19 virus debe ser indizado con el descriptor Glicoproteína de la Espiga del Coronavirus.

Precodificado – Embarazo

Todos los documentos sobre mujeres embarazadas o animales preñados deberán tener ese aspecto indizado. Siempre incluir Femenino y Humanos u Animales).

 

Ejemplo 1:
Efecto de la penicilina en el hígado (el texto se refiere a hombres y mujeres, una de las cuales está embarazada).

Descriptores primarios
Penicilinas /farmacol
Hígado /ef drogas

Precodificados
Humanos
Masculino
Femenino
Embarazo

 

Ejemplo 2:
Efecto de la penicilina en el hígado de perros (el estudio utiliza perros machos y hembras como animales de experimentación y una de las hembras está preñada).

Descriptores primarios
Penicilina /farmacol
Hígado /ef drogas

Precodificados
Perros
Animales
Femenino
Embarazo y no Preñez

Precodificados – Edades

Seleccionar todos los grupos de edades descritos en el documento, incluso si parece obvio.

Ejemplo:
Conducta infantil, deberá ser indizado con: Humanos, Niño o específico conforme el documento.

  • Rango de edad

Cuando el documento presenta un rango de edades seleccionar todos los grupos pertinente.

Ejemplos:

Sujetos con edades de 7 hasta 79, deberá ser indizado con: Humanos, Niño, Adolescente, Adulto Joven, Adulto, Mediana Edad y Anciano.
Sujetos con edades de 19 a 44, indizar con: Humanos, Adulto Joven y Adulto.

  • Rango de edad expresa con signos con signos + (suma) y – (resta)

 

Edades que aparecen entre paréntesis con signos + -, hacer las cuentas para menos y para más e incluir todas las edades.

Ejemplo:
Pacientes con edades (56+-10 años), la indización será: Humanos, Mediana Edad y Anciano.

Reglas para grupos de edad:

Si en el documento consta

Use

No use

Lactante Lactante(1 hasta 23 meses Recién Nascido (hasta 1 més) y Lactante (1 a 23 meses)
Niño Niño (6-12) Preescolar (2-5) y Niño (6-12)
Adulto Adulto (19-44) Mediana Edad (45-64), Adulto (19-44) y Adulto Joven (19-24)

Precodificados – Animales

Los estudios experimentales con uso de modelos animales o estudios sobre enfermedades animales deben incluir el precodificado Animales y cuando especificado indizar también: Masculino, Femenino, Ratas, Ratones, Cobayas etc.

Además de los precodificados, si el documento cita, incluir como descriptor secundario la especie del animal.

Ejemplo:

Ratas Wistar, Ratas Sprague-Dawley

 

Precodificados x Descriptores

Algunos precodificados pueden ser indizados como descriptor primario, cuando son el tema central/principal del documento.

Precodificados no aceptan calificadores. Por consiguiente, cuando sea necesario usar un calificador, el deberá ser indizado como descriptor primario con uno de los calificadores disponibles.

Los precodificados: Humanos, Animales, Masculino y Femenino, nunca son indizados como primario.

  • Embarazo normal

Embarazo será indizado como descriptor primario solamente para estudios de embarazo normal como foco principal del documento.

Ejemplo:

Fisiología del embarazo en países en desarrollo.

Descriptores primarios
Embarazo/fisiol
Países en Desarrollo

Precodificados
Humanos
Femenino

 

  • Recién nacido normal

Si el recién nacido normal es el asunto principal del documento se debe usar el descriptor Recién Nacido como descriptor primario.

Ejemplo:

Aspectos fisiológicos de la respiración en el recién nacido.

Descriptores primarios
Respiración/fisiol
Recién nacido/fisiol

Precodificados
Humanos

*Nota: Cuando se indiza Recién nacido o Embarazo como descriptor primario, NO indizar también como precodificados, pues habrá duplicación de descriptores.

Documentos sobre enfermedades en recién nacido son indizados por el descriptor de la enfermedad específica (primario o secundario) y con el precodificado Recién Nacido (más Humanos y Masculino o Femenino si declarado).

Precodificados: coordinaciones

Algunos términos DeCS/MeSH exigen la indización de los precodificados pertinentes.

Ejemplos:
Adolescente hospitalizado: coordinar con Humanos y Adolescente
Mastitis bovina: coordinar con Animal y Bovino
Neoplasias da Próstata: coordinar con Humanos y Masculino

Agradecimientos

Al equipo de la Biblioteca Médica Nacional del Centro Nacional de Información de Ciencias Médicas – INFOMED por la revisión de las notas técnicas.

Referencias

BIREME/OPAS/OMS. Manual de Indización de Documentos para la Base de Datos LILACS. 2.ed. rev. ampl. São Paulo: BIREME, 2008. 373 p. Disponible en:
http://docs.bvsalud.org/biblioref/2018/05/883287/lilacs-4-manualindexacao-es.pdf. Acceso en 07/05/2018.

Conceição, Maria Anália da; Suga, Sueli Mitiko Yano. Sesión 3 de 10 – Uso de precodificados en la indización de documentos LILACS [Presentación]. 25 Mayo. 2017. Disponible en: https://www.slideshare.net/Rede_BVS/sesin-2-de-10-indización-con-uso-de-precodificadoslímites. Acceso en 07/05/2018.

Versiones anteriores de la nota técnica:

Indización de documentos sobre el COVID-19 y Coronavirus del Síndrome Respiratoria Aguda Grave 2 (SRAG-CoV-2). versión 15/04/2020. Disponible en: https://docs.bvsalud.org/biblioref/2020/07/1103187/nota-tecnica-covid-19esrag-cov-2-20200415-1.pdf

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