Muitos termos AF estarão relacionados a outros termos PA; por exemplo, um mecanismo particular de um dado receptor pode resultar em um efeito farmacológico. O registro para a AF terá uma referência para a outra AF relacionada. Os indexadores deverão sempre procurar pelos termos relacionados nos registros assim como as AFs. Por exemplo, o registro para INIBIDORES DE CAPTAÇÃO DE SEROTONINA tem uma referência para o termo relacionado ANTIDEPRESSIVOS DE SEGUNDA GERAÇÃO porque muitos inibidores de captação da serotonina agem como anti-depressivos.