O DeCS traz o descritor FUNGOS e vários descritores para gêneros específicos de fungos. Na ausência de um gênero específico, indexar um fungo pelo próximo grupo taxonômico superior que for um descritor. Se o autor não identificar o grupo ao qual um determinado fungo pertence, o indexador deve verificar em fontes disponíveis (dicionários, por ex.). O fungo a ser indexado será quase sempre identificável alí ou através de alguma pista no texto. As doenças causadas por fungos são chamadas MICOSES e aparecem na Categoria C1.